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人杯狀病毒的檢測

發(fā)布時間:2007-01-11 信息來源: 點擊量:
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一,、ELISA檢測人杯狀病毒

采用IDEIA? Norovirus試劑盒(DakoCytomation公司),,僅限于檢測人杯狀病毒中的諾如病毒(屬)GⅠGⅡ型,。

(一)檢測前準備工作

1.糞便標本處理:加入1ml樣品稀釋液(sample diluent)至1.5ml EP管中,,加入0.1g固體糞便標本或0.1ml液體糞便標本,,置于漩渦震蕩器混勻,室溫靜置10min,,室溫下≥5000rpm離心5min,。

2.陰性對照:將1ml樣品稀釋液(sample diluent)加至標記好的小瓶中作為陰性對照。

3.陽性對照:1ml對照稀釋液(control diluent)溶解陽性對照,,使用前混勻,。

4.洗液的配制:1倍體積的洗液濃縮液,加9倍體積的去離子H2O,。當天用當天配,。

(二)標本檢測

1.    將需要數(shù)量的微孔板置于微孔板架上。

2.    每孔加入100μl 10%便懸液或陰性對照或陽性對照(每次檢測均需加一個陽性對照和一個陰性對照),,2030℃靜置60±5min,。

3.    每孔加入2滴(或100μl)酶結合物(conjugate),用槍頭輕柔混勻,。

4.    每孔加入350μl洗液,,洗5次,在衛(wèi)生紙上拍干,。

5.    每孔加入2滴(或100μl)底物液(Substrate),,2030℃靜置30min。待藍色顯現(xiàn)后迅速觀察顏色,。

6.    每孔加入2滴(或100μl)終止液(Stop solution),,充分混勻。

7.    讀取OD450值,,打印輸出或記錄OD值,。結果必須在加入終止液后30min內(nèi)讀取。

() 檢測結果的判定:

1.    陰性對照:肉眼觀察無色或OD450<0.15,。

2.    臨界值:OD450值=陰性對照OD450值+0.10,。

3.    陽性對照:肉眼觀察呈現(xiàn)獨特的藍色或OD450>0.50

4.    標本:肉眼觀察藍色比陰性對照顏色深判定為陽性,肉眼觀察無色判定為陰性,;或者OD450值大于臨界值判定為陽性,,小于臨界值判定為陰性,OD450值在臨界值±0.01范圍內(nèi)判定為可疑,,應重復檢測,。

(四)注意事項:

1.打開后的96微孔板應置于可封口的有干燥劑的口袋中貯存于28℃,打開后6周內(nèi)用完,。

2.終止液中含0.3mol/L硫酸,避免接觸到皮膚和粘膜,。如果終止液接觸到這些部位立即用水沖洗,。

3.未用完的陽性對照可在28℃貯存1個月,長期貯存應分裝存于-20℃,。

4.底物液避光保存,,不要使用已經(jīng)變藍的底物液。

5.避免污染,。

二,、人杯狀病毒RT-PCR檢測

可以同時檢測出人杯狀病毒中諾如病毒(屬)和扎如病毒(屬)。

(一)病毒RNA提?。?/span>

1.提取前的準備工作:

(1)    1ml Buffer AVL加入裝有低壓凍干的Carrier RNA中,,徹底溶解Carrier RNA后,將溶有Carrier RNABuffer AVL轉(zhuǎn)入至Buffer AVL瓶中,,徹底混勻,。分裝貯存于28℃。如果在28℃時,,Buffer AVL/Carrier RNA溶液形成沉淀,,可在80℃重新溶解,注意加熱的時間不能超過5min,,用前冷卻至室溫,。Buffer AVL/ Carrier RNA溶液不能加熱超過6次。

(2)    加入合適比例的96100%的酒精至Buffer AW1中,,19mlBuffer AW1加入酒精25ml,。

(3)    加入合適比例的96100%的酒精至Buffer AW2中,13mlBuffer AW2加入酒精30ml,。

2.病毒RNA的提?。?/span>

(1)    1.5ml EP管中加入560μl 已加入Carrier RNABuffer AVL

(2)    140μl 10%便懸液加入至EP管中的Buffer AVL中,,vortex混勻15sec,。

(3)    室溫(1525℃)孵育10min

(4)    1.5ml EP管輕微離心,以去除管內(nèi)的液滴,。

(5)    在管內(nèi)加入560μl 96100%的酒精,,vortex混勻15sec?;靹蚝?,將1.5ml EP管輕微離心,以去除管內(nèi)的液滴,。

(6)    小心的將630μl步驟5中的溶液加入至已放入至2ml收集管中的QIAamp離心柱中,,注意不要弄濕柱子邊緣。蓋上蓋子,,8000rmp離心1min,。將QIAamp離心柱放置至另一干凈的2ml收集管中,棄去包含有濾過液的收集管,。

(7)    小心打開QIAamp離心柱的蓋子,,重復步驟6

(8)    小心打開QIAamp離心柱的蓋子,,加入500μl Buffer AW1,。蓋上蓋子,8000rmp離心1min,。將QIAamp離心柱放置至另一干凈的2ml收集管中,,棄去包含有濾過液的收集管。

(9)    小心打開QIAamp離心柱的蓋子,,加入500μlBuffer AW2,。蓋上蓋子,14,000rmp離心3min,。棄去收集管中的濾過液,,14,000rmp離心空柱子1min

(10)QIAamp離心柱放置入干凈的1.5ml離心管中,。棄去包含有濾過液的收集管,。小心打開QIAamp離心柱的蓋子,加入60μl Buffer AVE至離心柱中,,蓋上蓋子,,室溫孵育1min8000rmp離心1min,。(2×40μlBuffer AVE洗脫兩次,,能增加產(chǎn)量。)病毒RNA進行反轉(zhuǎn)錄,,或貯存于-20℃或-70℃備用,。

(二)人杯狀病毒ssRNA的反轉(zhuǎn)錄:

0.2mlEP管中配制如下逆轉(zhuǎn)錄體系,。

10×緩沖液                        2.5 μl

25 mM MgCl2                        4 μl

2.5mM dNTPs                         5μl

1% BSA                                2.5μl

0.2 μg/ μl引物289混合液        1μl

10 U/μl AMV-RT                0.35μl

50 U/μl RNasin                      0.1μl

DEPC處理H2O                  8.05μl

RNA                                      1.5μl

25μl,混勻,,輕微離心,,42℃反轉(zhuǎn)錄1hr

(三)人杯狀病毒cDNA PCR擴增

0.2ml EP管中配制如下PCR體系:

10×緩沖液        5μl

25mM MgCl2        4μl

10mM dNTPs        1μl

0.2 μg/ μl引物289混合液  1μl

0.1μg/ μl引物290混合液  1μl

5 U/μl Taq      0.4 μl

DEPC處理H2O       29.6μl

cDNA             8μl

50μl,,混勻,,輕微離心,放入PCR儀中擴增,,反應條件:94℃變性3min后,,94℃ 60s58℃1min20s,,72℃1min,,進行30個循環(huán),72℃延伸10min,。反應結束后1.5%瓊脂糖凝膠電泳或4℃保存PCR產(chǎn)物。

1  人杯狀病毒RT-PCR所用的引物

引物

位置

方向

核酸序列(5’3’)

289H

4865-4886

-

TGACGATTTCATCATCACCATC

289I

4865-4886

-

TGACGATTTCATCATCCCCGTC

290H

4568-4590

+

GATTACTCCAGGTGGGACTCCAC

290I

4568-4590

+

GATTACTCCAGGTGGGACTCAAC

290J

4568-4590

+

GATTACTCCAGGTGGGATTCAAC

290K

4568-4590

+

GATTACTCCAGGTGGGATTCCAC

(四)檢測結果的判定:

15μl RT-PCR擴增產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠上電泳,。人杯狀病毒諾如屬擴增產(chǎn)物大小為319bp,,扎如屬擴增產(chǎn)物大小為331bp

(五)注意事項:

1.    槍頭避免觸及QIAamp離心柱的濾過膜,。

2.    避免污染,。應該戴手套進行操作。PCR實驗室應該分為3個區(qū):試劑準備區(qū),,樣品準備區(qū),,擴增和檢測區(qū)。

3.    EB可能致癌,,必須小心操作,,劃定EB污染區(qū)。

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